Pada tanggal 14 Januari 2025 telah dilaksanakan audit internal di UNEJ Kampus Bondowoso. Kegiatan audit mencakup monitoring dan evaluasi bidang Pengadaan Barang dan Jasa (PBJ), Bidang Barang Milik Negara (BMN), dan Bidang Keuangan, serta Cash Opname dan Stock Opname.