Tujuan dibentuknya Satuan Pengawasan Internal sesuai dengan pengertian pada Permendiknas nomor 47 tahun 2011 pasal 1 ayat 1 adalah untuk melaksanakan proses kegiatan audit, reviu, evaluasi, pemantauan, dan kegiatan pengawasan lain terhadap penyelenggaraan tugas dan fungsi organisasi yang bertujuan untuk mengendalikan kegiatan, mengamanka harta dan aset, terselenggaranya laporan keuangan yang baik, meningkatkan efektivitas dan efisiensi, dan mendeteksi secara dini terjadinya penyimpangan dan ketidakpatuhan terhadap ketentuan peraturan perundang-undangan sehingga terbentuk “Good University Governance”
SPI adalah organ yang melaksanakan tugas di bidang pengawasan internal Universitas Jember dengan berkoordinasi dan bertanggung jawab kepada Rektor. SPI terdiri dari 6 divisi antara lain Divisi Keuangan, Divisi Akuntansi, Divisi Barang Milik Negara, Divisi Pengadaan Barang dan Jasa, Divisi Sumber Daya Manusia, dan Divisi Sistem Manajemen Mutu dan Anti Penyuapan. Setiap divisi dapat beranggotakan lebih dari 1 (satu) orang yang kedudukannya bersifat kolektif-kolegial. SPI dalam melaksanakan tugas pengawasan dibantu oleh Tenaga Fungsional Auditor Internal atau Kelompok Auditor Internal (Pool of Auditor) yaitu auditor internal yang bertugas di bidang pengawasan internal organisasi yang berkedudukan di bawah kendali Ketua SPI. Tenaga Fungsional Auditor Internal dan Kelompok Auditor Internal (Pool of Auditor) dalam melaksanakan tugas bertanggung jawab langsung kepada Ketua SPI.
Dalam rangka mewujudkan Good University Governance, Universitas Jember terus melakukan pembenahan internal. Salah satu usaha nyata dari Universitas Jember dalam mewujudkan tata kelola Universitas yang baik, pada awal Mei 2012 Rektor Universitas Jember membentuk satuan kerja baru yaitu Satuan Pengawasan Internal (SPI). Keberadaan SPI di lingkungan Universitas merupakan kebutuhan untuk meningkatkan akuntabilitas dalam pengelolaan Universitas.